Elastic Stack
strange not working
History
2004 compass
2010
format JSON
JSON (JavaScript Object Notation) permet de stocker des données textuelles. L’absence de schéma du format JSON lui offre une grande flexibilité dans le stockage de ses données. D’autant plus qu’il possède une syntaxe simple et une structure en arborescence lui permettant de rester efficace même en cas de gros volume de données
Log files
Chaque ordinateur tient un journal de bord des événements qui ont eu lieu sur celui-ci. Ces informations sont stockées dans des fichiers appelés Logs. Log est le diminutif de logging. On peut extraire de nombreuses informations de ces fichiers, mais généralement on les utilisent pour déterminer le ou les facteurs qui entraînent le mauvais fonctionnement d’un processus ou d’un logiciel. Consulter les fichiers de logs d’une seule machine est relativement facile. Cela devient rapidement plus compliqué quand le nombre de celle-ci augmente, une des solutions à ce problème : la centralisation des logs. Dans Ubuntu, la majorité des fichiers de logs se trouve dans le dossier suivant : cd /var/log
Les données que nous cherchons à extraire de ces fichiers sont:
- Les erreurs système
- Les statuts de certains services (nfs, apache, postgresql, mariadb)
- L’espace disque occupé
- L’utilisation du CPU
- L’utilisation de la mémoire RAM
- Le nombre de connections avec leurs IPs sur les serveurs Web.
- Le nombre de requêtes et leurs durées pour les bases de données.
logstash filtre
Grafana
Grafana est une alternative à Kibana pour la partie monitoring et des alertes, et est donc similaire, en plus d'être compatible avec Elasticsearch.
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Elastic Stack
strange not workingAPR 2024 · PIERRE-EDOUARD GUERIN -
What is a bad programmer?
Coding refers to the act of writing instructions in a programming language. In that sense, the coder is also a programmer. Since a program in a computer is a set of instructions to execute specific tasks. Thus, a programmer is never alone, he is always working at the very least with the computer. Moreover, every program must serve a clear purpose: automating a routine task, performing repetitive or complex calculations, managing data, and so on. In bioinformatics, such programs are typically designed to transform raw biological data into formats that can be effectively used by other specialists for further analysis.DEC 2023 · PIERRE-EDOUARD GUERIN -
RNA-Seq
One of the approaches to study host–pathogen interactions at the molecular level is RNA sequencing (RNA-Seq). This technology provides access to gene expression profiles in various conditions such as viral infection or environmental stress. I had the opportunity to process RNA-Seq data from sugar beet plants to investigate transcriptional responses to virus yellows disease, a condition caused by a complex of aphid-transmissible viruses. Here, I describe transcriptomics and the methods used for RNA-Seq data analysis.AUG 2022 · PIERRE-EDOUARD GUERIN